在辽河流域依据不同的河流类型共建立了包括5方面、67个备选指标库，通过压力-响应模型确定能够准确反映评估区域环境压力的物理、化学和生物指标共计16个，参考中国《地表水环境质量标准》（3838-2002）和其他在研究区域和非研究区域的相关参考文献确定了每个评价指标的阈值范围，并依据不同指标类型确定适用的指标标准化方法，最终根据专家经验对每个评价指标进行权重的分配，最终根据评价标准界定了辽河流域主要研究区域的河流健康状况。结果显示，辽河流域河流健康受损较重，未达到“良”等级的样点有146个，所占比例高达83 %，主要分布在浑河、东辽河和西辽河流域，这些流域受到来自城市、工业及农业面源污染较大；“良”等级的样点只有30个，主要分布在太子河流域上游地区，这些样点受到人类干扰较少；整个流域鱼类类群存在显著退化趋势，其中西辽河的鱼类类群衰退现象最明显。该评价体系建立所涉及的备选指标库的建立、评价指标的筛选、指标阈值的界定、评价指标权重的分配以及健康标准的建立，均遵循了学术界认可的方法学或者通过了相关专家的论证，因此该评价指标体系可以全面客观地反映河流当前所处的健康状况，并针对流域的水生态退化现状做出诊断。